在nerv僅剩的最后一塊完好無損的停機坪上空，一架黑色的軍用直升機正在緩緩降落，巨大的螺旋槳在地面上卷起一陣陣強有力的氣流，李曉站在停機坪的邊緣，被氣流吹的有些睜不開雙眼。
　　從李曉往左看去，依次站著明日香、真嗣、美里和碇司令，今天他們來到這里主要是為了接一個人。
　　直升機安穩(wěn)的落在停機坪上，艙門打開，一個留著小辮子、一臉輕浮笑容的男人從其中走了下來，看見這個人，美里和明日香的臉上忍不住露出笑容，這個人正是許久不見的加持良治。
　　李曉一行人立刻迎了上去，碇司令一馬當(dāng)先的來到加持面前，他的臉上帶著微微意外的神色，對加持說:“沒想到你竟然還活著?！?br/>　　加持還是老樣子，笑了笑，視線看向站在后面的李曉:“多虧了吉人相助啊。”
　　碇司令疑惑的微微一皺眉，他轉(zhuǎn)過頭，順著加持的視線看過去，視線也落在了李曉身上，驚愕的表情在他臉上一閃而過，心說:又是李曉！
　　李曉走上前，抬手打了個招呼:“加持先生，與政府那邊聯(lián)系上了嗎？”
　　“多虧了當(dāng)初在內(nèi)務(wù)府工作時建立的一點小關(guān)系，總算是順利搭上這條線了。不過，之后的工作就得看碇司令的了。”加持扭頭看向碇司令，語氣輕松的說道。“如果司令斡旋失敗，恐怕我的腦袋也保不住了吧，這還真是一份費力不討好的工作啊?！?br/>　　碇司令：“這里不是說話的地方，跟我來吧。”
　　然后，碇司令和美里帶著加持和另一位內(nèi)務(wù)府特工離開了，李曉、明日香和真嗣沒有跟過去，李曉本來就是過來看看加持先生的，談判的事情李曉沒興趣參與。
　　碇司令與加持談了整整一天的時間，具體談了什么李曉不得而知，也沒興趣知道，他只知道談判結(jié)束后，碇司令決定和加持一起去第二新東京市，當(dāng)面向政府澄清nerv的清白，并且揭露seele的陰謀。
　　三天后，碇司令、冬月副司令和加持開始動身，臨行前，nerv的一干人等來到停機坪送別。
　　上飛機前，碇司令對美里說：“接下來nerv就交給你了，如果我和冬月無法回來的話，你就是nerv的下一任司令?！?br/>　　美里挺直腰桿，面色沉重的向碇司令敬了個軍禮，鏗鏘的回答道：“明白！”
　　李曉和真嗣站在美里身后，真嗣看著自己的父親，臉上帶著擔(dān)憂的神色，幾次張開嘴但卻欲言又止。盡管真嗣與碇源堂的父子關(guān)系不太好，但畢竟血濃于水，這種時候真嗣還是非常擔(dān)心自己父親的。
　　李曉見狀無奈的嘆了一聲，在后面悄悄地推了真嗣一把。真嗣被推著向前邁了兩步，來到了碇司令身前。
　　碇司令看向真嗣，感受到父親嚴厲的目光，真嗣立馬害怕的低下頭?？墒沁@一次，碇司令卻主動開口了。他對真嗣說：“真嗣，我不在的日子里，你要保護好大家。”
　　聽到父親的話，真嗣驚訝的猛地抬起頭，他從沒想到父親會對他說出這樣的話，人生中第一次，真嗣感覺自己終于得到了父親的認同。他的心中立刻燃起勇氣，用力的一點頭：“恩，我會的。還有……父親，你一路保重，我等你回來?！?br/>　　碇司令最后深深地看了真嗣一眼：“再見。”
　　然后，碇司令與冬月副司令登上直升機，直升機在螺旋槳的帶動下緩緩升起，向著遠方迅速飛去，漸漸消失在遠處的天際線上。