回到留城，部隊帶回營地，由趙云統(tǒng)率訓練龍騎營，由張遼帶高順親自訓練的三十人統(tǒng)率訓練陷陣營。而劉琦則得到短暫的安寧。陪貂蟬張寧一起讀書，與鄭玄一起研究《算術(shù)》，同左伯毛弦討論書法改進造紙……生活輕松而充實。
　　公元187年，中平四年。
　　二月，滎陽農(nóng)民起義。斬殺中牟令落皓及主薄潘業(yè)。三月，河南尹何苗帶兵平叛，義軍敗。
　　韓遂殺邊章及北宮玉伯、李文侯，進攻隴西。隴西太守李相如反叛，與韓遂結(jié)盟。
　　八月，原中山太守張純糾結(jié)原泰山大守張舉反叛。與烏桓大山丘力居結(jié)盟，殺護烏桓校尉公綦稠、右北平太守劉政、遼東太守陽眾。漢靈帝命南匈奴單于羌渠率兵隨幽州刺史劉虞進討張純，休屠各胡反。又令騎都尉公孫贊率兵平叛，公孫贊大勝于石門。
　　同時，長沙區(qū)星率眾造反。朝庭任命孫堅為長沙太守，剿滅區(qū)星。孫堅因平叛有功被封烏程侯。
　　而留城的劉琦則與鄭玄一同完成《算術(shù)》的編注，與左伯毛弦改進的“左伯紙”初成。
　　趙云多次率龍騎營突進草原腹部驅(qū)逐鮮卑部落，步度根不堪受擾，下令西部各部落紛紛北遷。“大漢龍騎”響徹大草原，趙云也贏得“龍膽將軍”稱號。
　　十一月，鄭玄的學生大儒管寧攜東萊人太史慈到留城。劉琦大喜，任太史慈為龍騎營副統(tǒng)領，隨趙云訓練騎兵。管寧則隨鄭玄專心治學教書。
　　同年，大儒陳寔病逝，終年84歲。海內(nèi)學士三萬余眾前往吊孝。
　　公元188年，中平五年。
　　二月，郭太等黃巾余眾在西河郡白波谷再度起事，聯(lián)合反叛的南匈奴休屠各部，攻略太原河東等地。西河郡守刑紀被休屠胡人殺死，南匈奴單于羌渠被殺，刺使張懿戰(zhàn)死。并州大亂。
　　三月，太常劉蔫以天下兵寇不息，刺史手中無兵權(quán)難以安定天下為由，上書靈帝，改刺史為州牧，加重其職權(quán)。靈帝為鎮(zhèn)壓此起彼伏的農(nóng)民起義，采納劉蔫見議，改刺史為州牧，并選派列卿、尚書出任州牧。宗正劉虞改任幽州牧，太常劉蔫任益州牧，太仆黃琬為豫州牧。于是州牧成為居于郡守之上的行政長官，擁有一州的行政大權(quán)，位高權(quán)重。從此州牧各據(jù)一方，形同割據(jù)，也加劇了漢末諸候紛爭局面的形成。
　　六月，益州馬相、趙祗起兵叛亂，殺刺史卻儉。益州從事賈龍聚州郡兵討代，迎劉璋為入川。
　　八月，靈帝見外威何進擁兵過重，為了制衡權(quán)勢熏天的何進、何苗兄弟，在西園置統(tǒng)帥部，組建新軍。新軍沒八校尉：上軍校尉宦官蹇碩、中軍校尉袁紹、下軍校尉鮑鴻、典軍校尉曹操、助軍左校尉趙融、助軍右校尉馮芳、左校尉夏牟、右軍校尉淳于瓊。上軍校尉蹇碩成為全國最高軍事統(tǒng)帥，外戚大將軍何進與宦官“十常士”勢同水火。
　　同年，太行山一帶黃巾余眾在張燕帶領下，居山立寨，北擾并州，南襲冀州，稱“黑山軍”。
　　十一月，王國叛亂，兵圍陳倉，靈帝拜皇甫嵩為左將軍，督前將軍董卓，引兵四萬，前往圍剿。